19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26000 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26000  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0065  tRNA-Leu  98.68 
 
 		 77 bp  143  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0030  tRNA-Leu  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0037  tRNA-Leu  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0045  tRNA-Leu  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14020  tRNA-Leu  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.579057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0050  tRNA-Leu  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.858981  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0037  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292769  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0042  tRNA-Leu  85.53 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140875  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0016  tRNA-Leu  85.53 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.0561514 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1377  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07920  tRNA-Leu  84.21 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0780487  normal  0.280122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32170  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.933066  normal  0.161534 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0011  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00310588  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0046  tRNA-Leu  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.745536  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0062  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000546753  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0028  tRNA-Leu  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.430531  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0013  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0584453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07980  tRNA-Leu  82.89 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>