31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_R0030 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0045  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26000  tRNA-Leu  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0042  tRNA-Leu  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140875  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0037  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292769  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0065  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0026  tRNA-Leu  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0023  tRNA-Leu  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320575  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0022  tRNA-Leu  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0265779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0023  tRNA-Leu  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0021  tRNA-Leu  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.729183  normal  0.627845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0037  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14020  tRNA-Leu  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.579057 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1377  tRNA-Leu  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0040  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14017  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.285332  normal  0.0623737 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0025  tRNA-Leu  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0050  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.858981  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0043  tRNA-Leu  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217988  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0045  tRNA-Leu  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0040  tRNA-Leu  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07920  tRNA-Leu  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0780487  normal  0.280122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28960  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363036 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0023  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000369375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0024  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304311  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0041  tRNA-Leu  83.82 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0115082  normal  0.081764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32170  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.933066  normal  0.161534 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0016  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.0561514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0052  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0018  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.44419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>