12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_R0023 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0265779  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320575  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0042  tRNA-Leu  98.68 
 
 
77 bp  143  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140875  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14020  tRNA-Leu  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.579057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0045  tRNA-Leu  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0037  tRNA-Leu  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292769  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0030  tRNA-Leu  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1377  tRNA-Leu  85.29 
 
 
74 bp  56  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0037  tRNA-Leu  84.21 
 
 
77 bp  56  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0019  tRNA-Leu  82.43 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000251522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>