28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32170 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32170  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.933066  normal  0.161534 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0016  tRNA-Leu  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.0561514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07980  tRNA-Leu  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096426  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0050  tRNA-Leu  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.858981  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07920  tRNA-Leu  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0780487  normal  0.280122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0011  tRNA-Leu  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00310588  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0025  tRNA-Leu  87.3 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05020  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0450088  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0065  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0019  tRNA-Leu  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512192  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0040  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26000  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0059  tRNA-Leu  87.3 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.495199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0028  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.430531  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14017  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.285332  normal  0.0623737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0021  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.729183  normal  0.627845 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0043  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217988  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0045  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0024  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0040  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0041  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0013  tRNA-Leu  82.89 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0584453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07080  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0052  tRNA-Leu  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442993  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0030  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0055  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0077  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148053  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0055  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509832  normal  0.38034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>