21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_R0059 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_R0059  tRNA-Leu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.495199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0025  tRNA-Leu  98.65 
 
 		 74 bp  131  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0040  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14017  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.285332  normal  0.0623737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0043  tRNA-Leu  93.24 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217988  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0040  tRNA-Leu  93.24 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0045  tRNA-Leu  93.24 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760508 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0041  tRNA-Leu  92 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07980  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096426  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0050  tRNA-Leu  88.16 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.858981  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0021  tRNA-Leu  88.16 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.729183  normal  0.627845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07920  tRNA-Leu  88.16 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0780487  normal  0.280122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0065  tRNA-Leu  86.84 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0016  tRNA-Leu  86.84 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.0561514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32170  tRNA-Leu  87.3 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.933066  normal  0.161534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0005  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0506914  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0018  tRNA-Leu  84 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.44419  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0052  tRNA-Leu  86.44 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442993  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05020  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0450088  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0051  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0024  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>