25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_R0025 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0059  tRNA-Leu  98.65 
 
 		 76 bp  131  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.495199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14017  tRNA-Leu  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.285332  normal  0.0623737 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0040  tRNA-Leu  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0043  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217988  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0045  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0040  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0041  tRNA-Leu  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0021  tRNA-Leu  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.729183  normal  0.627845 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07980  tRNA-Leu  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096426  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07920  tRNA-Leu  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0780487  normal  0.280122 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0050  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.858981  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0016  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.0561514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0065  tRNA-Leu  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32170  tRNA-Leu  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.933066  normal  0.161534 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0024  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304311  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0052  tRNA-Leu  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442993  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05020  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0450088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0023  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000369375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0018  tRNA-Leu  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.44419  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0030  tRNA-Leu  85.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0045  tRNA-Leu  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0005  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0506914  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0034  tRNA-Leu  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0011  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00310588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>