23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_R0051 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0050  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.858981  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0073  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0053  tRNA-Leu  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0018  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.44419  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0005  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0506914  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0020  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.435653  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0019  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512192  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0019  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000251522  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28960  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363036 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0059  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.495199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101821  hitchhiker  0.0000000869798 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0018  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446903  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1355  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0077651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14020  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.579057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20260  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0020  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.790666  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0049  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000532308  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0031  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0065  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.840462  normal  0.934802 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0018  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00379484  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0038  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>