41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_R0050 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.858981  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0051  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32170  tRNA-Leu  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.933066  normal  0.161534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0065  tRNA-Leu  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0016  tRNA-Leu  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.0561514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0018  tRNA-Leu  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.44419  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0025  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07920  tRNA-Leu  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0780487  normal  0.280122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26000  tRNA-Leu  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0073  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0059  tRNA-Leu  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.495199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07980  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096426  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0011  tRNA-Leu  87.3 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00310588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0003  tRNA-Leu  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0053  tRNA-Leu  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07080  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0040  tRNA-Leu  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0030  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28960  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363036 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14017  tRNA-Leu  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.285332  normal  0.0623737 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0028  tRNA-Leu  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.430531  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0021  tRNA-Leu  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.729183  normal  0.627845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14020  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.579057 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0019  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000251522  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20260  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0020  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.435653  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0019  tRNA-Leu  82.89 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512192  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0046  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.745536  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0038  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0013  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0584453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0037  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.840462  normal  0.934802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0038  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0037  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292769  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0038  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.726188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0040  tRNA-Leu  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1355  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0077651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0045  tRNA-Leu  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760508 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0033  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0036  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.386094  normal  0.194002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0043  tRNA-Leu  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>