18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_R0018 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.44419  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0053  tRNA-Leu  90.54 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07920  tRNA-Leu  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0780487  normal  0.280122 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0050  tRNA-Leu  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.858981  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0052  tRNA-Leu  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442993  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0005  tRNA-Leu  89.04 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0506914  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0020  tRNA-Leu  87.18 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.790666  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0051  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393189 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0011  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00760803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0021  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07080  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0025  tRNA-Leu  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0073  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0059  tRNA-Leu  84 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.495199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0013  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0584453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0030  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05020  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0450088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0040  tRNA-Leu  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>