11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_R0053 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_R0053  tRNA-Leu  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0018  tRNA-Leu  90.54 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.44419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0073  tRNA-Leu  88.73 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0051  tRNA-Leu  86.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0050  tRNA-Leu  86.49 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.858981  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0011  tRNA-Leu  86.76 
 
 
74 bp  56  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00760803  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0005  tRNA-Leu  86.11 
 
 
77 bp  56  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0506914  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 
78 bp  54  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.790666  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0029  tRNA-Leu  96.3 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0041  tRNA-Leu  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>