9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_R0029 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0025  tRNA-Leu  88.73 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0046  tRNA-Leu  87.5 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.745536  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0028  tRNA-Leu  86.76 
 
 
74 bp  56  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.430531  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0038  tRNA-Leu  86.11 
 
 
74 bp  56  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.726188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20260  tRNA-Leu  86.11 
 
 
77 bp  56  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0038  tRNA-Leu  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0024  tRNA-Leu  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0053  tRNA-Leu  96.3 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
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