23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20260 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20260  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.726188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0033  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0028  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.430531  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0034  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0046  tRNA-Leu  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.745536  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0029  tRNA-Leu  86.11 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0013  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0584453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0032  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421974  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.442264 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14020  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.579057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0025  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0050  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.858981  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0054  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108203  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0024  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0008  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0038  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0038  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07920  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0780487  normal  0.280122 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0058  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.386094  normal  0.194002 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0051  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>