17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_R0034 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0033  tRNA-Leu  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20260  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0038  tRNA-Leu  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.726188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07920  tRNA-Leu  88.57 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0780487  normal  0.280122 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0052  tRNA-Leu  92.45 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442993  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0028  tRNA-Leu  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.430531  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0046  tRNA-Leu  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.745536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0026  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.442264 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0032  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421974  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0041  tRNA-Leu  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0025  tRNA-Leu  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.386094  normal  0.194002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>