13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_R0036 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.386094  normal  0.194002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0032  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421974  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0026  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.442264 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14020  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.579057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07920  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0780487  normal  0.280122 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.745536  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.430531  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.726188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0050  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.858981  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20260  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.124528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>