17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_R0013 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_R0013  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0584453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0052  tRNA-Leu  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442993  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0016  tRNA-Leu  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.0561514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07920  tRNA-Leu  85.53 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0780487  normal  0.280122 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0019  tRNA-Leu  84.21 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512192  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20260  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0038  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.726188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0028  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.430531  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26000  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0033  tRNA-Leu  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32170  tRNA-Leu  82.89 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.933066  normal  0.161534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0050  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.858981  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0065  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0015  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0018  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.44419  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0016  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0485613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0020  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.790666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>