14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1377 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1377  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0019  tRNA-Leu  92.65 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000251522  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0030  tRNA-Leu  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26000  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0037  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292769  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0026  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0023  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0022  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0265779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0023  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320575  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0042  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140875  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0045  tRNA-Leu  85.94 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0065  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0021  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.729183  normal  0.627845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0037  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>