16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28960 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28960  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0115082  normal  0.081764 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0047  tRNA-Leu  89.23 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101821  hitchhiker  0.0000000869798 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.858981  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06840  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0027  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0211133  hitchhiker  0.000000873105 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.840462  normal  0.934802 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000251522  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0016  tRNA-Leu  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00310588  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0039  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>