26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_R0026 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0562701  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0012  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 86 bp  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0002  tRNA-Ser  92.41 
 
 		 89 bp  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0001521  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0002  tRNA-Ser  92.41 
 
 		 89 bp  101  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000210278  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0021  tRNA-Ser  91.78 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.443541  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0011  tRNA-Ser  88.61 
 
 		 89 bp  77.8  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0011  tRNA-Ser  88.61 
 
 		 89 bp  77.8  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000356582  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0059  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00150158  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0051  tRNA-Ser  87.14 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0047  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.232524  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0008  tRNA-Ser  84.72 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0018  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446903  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0049  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000532308  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0031  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0018  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00379484  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19630  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93343  normal  0.0188921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0006  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.435653  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0014  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00310588  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0006  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6024  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658515  normal  0.58924 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0014  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044253  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0006  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>