24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_R0026 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0035  tRNA-Leu  88.24 
 
 
84 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179216  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0035  tRNA-Leu  88.24 
 
 
84 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185716  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0038  tRNA-Leu  88.24 
 
 
84 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0020  tRNA-Leu  84.62 
 
 
88 bp  60  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  56  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6024  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658515  normal  0.58924 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00150158  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0047  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.232524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000356582  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00310588  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0049  tRNA-Thr  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000532308  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0018  tRNA-Thr  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446903  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0031  tRNA-Thr  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0019  tRNA-Leu  86.27 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.819942 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0018  tRNA-Thr  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00379484  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0047  tRNA-Leu  96.3 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230626  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0562701  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0021  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.443541  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000210278  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0012  tRNA-Ser  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0001521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>