25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_R0021 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_R0021  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.443541  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0002  tRNA-Ser  91.01 
 
 
89 bp  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0001521  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0002  tRNA-Ser  91.01 
 
 
89 bp  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000210278  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0011  tRNA-Ser  89.89 
 
 
89 bp  97.6  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0011  tRNA-Ser  89.89 
 
 
89 bp  97.6  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000356582  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0047  tRNA-Ser  90 
 
 
90 bp  91.7  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.232524  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0026  tRNA-Ser  91.78 
 
 
86 bp  89.7  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0562701  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0012  tRNA-Ser  90.41 
 
 
86 bp  81.8  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0059  tRNA-Ser  87.84 
 
 
88 bp  67.9  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00150158  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0008  tRNA-Ser  86.3 
 
 
88 bp  58  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0049  tRNA-Thr  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000532308  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0031  tRNA-Thr  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0018  tRNA-Thr  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0018  tRNA-Thr  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00379484  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19630  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93343  normal  0.0188921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0006  tRNA-Ser  96.15 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0014  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0020  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.435653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00310588  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0006  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6024  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658515  normal  0.58924 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0014  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044253  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0006  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>