33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_R0031 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0696891  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.264457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0024  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 84 bp  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.154328 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  71.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.840462  normal  0.934802 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0020    95.24 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00753616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0008  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0010  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.364833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0007  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0058  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0009  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA50  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.391222  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0042  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0050  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.822506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0052  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0027  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 83 bp  58  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130394  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0025  tRNA-Leu  95 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0001623  hitchhiker  0.000378957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0006  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.806028  normal  0.553629 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0032  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0572  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0054  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0764192  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu04  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617497 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0037  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000169907 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0070  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>