226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1556 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1556  ribosomal protein L35  100 
 
 		 69 aa  134  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.637628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  62.3 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  59.02 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  51.67 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  51.67 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  55 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  54.1 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  54.1 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  56.67 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  54.1 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  51.67 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  53.33 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1313  50S ribosomal protein L35  51.67 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.711955  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  51.67 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  60.1  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2354  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0495089  normal  0.100327 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2607  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  51.67 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1343  ribosomal protein L35  54.39 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000164157  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  51.67 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  53.33 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4254  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  50.85 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  47.46 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  50.85 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0222  50S ribosomal protein L35  52.73 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.0000299958  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  52.46 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  46.55 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  48.33 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  47.46 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2489  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000637036  hitchhiker  0.0000746157 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  44.26 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  51.67 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  51.67 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2026  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0783263  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  46.67 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  45.76 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  44.07 
 
 		 64 aa  52  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  53.45 
 
 		 68 aa  52  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119658  ribosomal protein L35, chloroplast precursor  44.26 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2016  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000210298  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  51.72 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2301  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1957  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  normal  0.347549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2019  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101706  normal  0.0487659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2045  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000199534  hitchhiker  0.00708309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5472  50S ribosomal protein L35  47.46 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1767  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852967  normal  0.0187188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  45.76 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2030  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000722543  hitchhiker  0.0000219314 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0189  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  46.67 
 
 		 79 aa  50.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  50.88 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  42.62 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  58.54 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  48.28 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  39.34 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  42.37 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  48.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  55.32 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  46.55 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  46.67 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1777  50S ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.786581 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  49.12 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>