80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1482 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1482  protein of unknown function DUF805  100 
 
 
371 aa  734    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.118245  normal  0.324958 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  38.46 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  28.8 
 
 
123 aa  61.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  35.29 
 
 
155 aa  60.1  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  39.56 
 
 
179 aa  59.7  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  32.76 
 
 
118 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  32.76 
 
 
118 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  32.76 
 
 
118 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  32.48 
 
 
123 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  32.76 
 
 
118 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  32.76 
 
 
118 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  32.76 
 
 
118 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  33.07 
 
 
120 aa  57.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  32.33 
 
 
131 aa  57.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  31.9 
 
 
122 aa  56.6  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0755  hypothetical protein  32.14 
 
 
109 aa  56.2  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  30.77 
 
 
125 aa  56.2  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  31.9 
 
 
118 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  31.9 
 
 
118 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1966  protein of unknown function DUF805  37.23 
 
 
142 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  34.75 
 
 
116 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  33.03 
 
 
119 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2568  hypothetical protein  41.57 
 
 
109 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000926681  normal  0.0635574 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  34.35 
 
 
115 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  32.31 
 
 
109 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  32.31 
 
 
138 aa  53.9  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  27.34 
 
 
123 aa  53.5  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  29.17 
 
 
193 aa  53.1  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  29.03 
 
 
127 aa  53.1  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0450  protein of unknown function DUF805  50 
 
 
210 aa  52.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.621893  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  28.57 
 
 
123 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  28.57 
 
 
123 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  28.57 
 
 
123 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  28.57 
 
 
123 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  34.62 
 
 
116 aa  52.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  26.61 
 
 
156 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  31.78 
 
 
126 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  30.71 
 
 
117 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  27.82 
 
 
166 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2604  hypothetical protein  31.65 
 
 
133 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  30.71 
 
 
117 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  31.78 
 
 
126 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  28.78 
 
 
128 aa  51.2  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  28.78 
 
 
128 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  28.78 
 
 
128 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4038  hypothetical protein  31.03 
 
 
112 aa  50.8  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511833  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0656  hypothetical protein  31.3 
 
 
109 aa  50.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00883836  decreased coverage  0.00160249 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  30.89 
 
 
121 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  30.89 
 
 
121 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  30.89 
 
 
121 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  30.89 
 
 
121 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  30.89 
 
 
121 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  30.89 
 
 
121 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  27.82 
 
 
143 aa  50.1  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3187  protein of unknown function DUF805  34.43 
 
 
134 aa  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.658779  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0992  hypothetical protein  42.05 
 
 
114 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  34.38 
 
 
114 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20900  predicted membrane protein  29.17 
 
 
137 aa  49.3  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.761588  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  32 
 
 
125 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  31.9 
 
 
126 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  34.02 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  27.27 
 
 
121 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  29.79 
 
 
168 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3455  hypothetical protein  36.26 
 
 
159 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  29.75 
 
 
200 aa  47  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  37.35 
 
 
113 aa  47  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1013  hypothetical protein  30.08 
 
 
136 aa  46.2  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  30.17 
 
 
146 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2214  protein of unknown function DUF805  36.71 
 
 
215 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  34.19 
 
 
116 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2412  hypothetical protein  26.21 
 
 
206 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2367  hypothetical protein  26.21 
 
 
206 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1691  hypothetical protein  26.55 
 
 
129 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.554195  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  36.05 
 
 
386 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  30 
 
 
121 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2599  protein of unknown function DUF805  41.18 
 
 
126 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1841  protein of unknown function DUF805  27.41 
 
 
153 aa  43.5  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2004  protein of unknown function DUF805  31.9 
 
 
125 aa  43.5  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3452  hypothetical protein  34.48 
 
 
68 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  26.67 
 
 
123 aa  42.7  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>