51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1691 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1691  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  261  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.554195  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1521  hypothetical protein  28.45 
 
 
100 aa  61.6  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0995988  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03531  hypothetical protein  29.51 
 
 
106 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  29.91 
 
 
123 aa  61.2  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  50 
 
 
193 aa  60.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20900  predicted membrane protein  22.31 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.761588  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0427  hypothetical protein  27.87 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.082341  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  25.86 
 
 
116 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  30.77 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  30.23 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  32.11 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  32.32 
 
 
386 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  33.8 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  39.58 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1470  hypothetical protein  25 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00332173  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  34.55 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  32.95 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  32.95 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  32.95 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  26.5 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  32.95 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.147236 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  32.95 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  32.95 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  26.5 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  26.77 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  32.95 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1966  protein of unknown function DUF805  29.79 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  28.3 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  32.95 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  32.95 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0275  hypothetical protein  24.31 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.560646  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  27.36 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  26.32 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  28.3 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  25.81 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15461  hypothetical protein  23.33 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.304816  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15831  hypothetical protein  23.33 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15681  hypothetical protein  23.33 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119235  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  26.26 
 
 
393 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  25.47 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  25.47 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  25.47 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  25.47 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  25.47 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  25.47 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  34.78 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  32.26 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4184  protein of unknown function DUF805  24.8 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.150084  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  27.68 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  24.19 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1013  hypothetical protein  28.42 
 
 
136 aa  40  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>