62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0275 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0275  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  295  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.560646  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0933  hypothetical protein  32.74 
 
 		 173 aa  72  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00253328  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2212  hypothetical protein  36.79 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00418947  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  32.86 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0196  hypothetical protein  31.85 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.667333  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  33.09 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1038  hypothetical protein  33.33 
 
 		 441 aa  57  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000431275  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1521  hypothetical protein  28.47 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0995988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20900  predicted membrane protein  30.07 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.761588  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  28.15 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15461  hypothetical protein  27.87 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.304816  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03531  hypothetical protein  25.19 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15681  hypothetical protein  28.1 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119235  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1470  hypothetical protein  28.69 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00332173  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  28 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  28 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  27.2 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  27.2 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  28 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  27.2 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  27.2 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  27.2 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  27.2 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1195  hypothetical protein  31.52 
 
 		 370 aa  47.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  30.39 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  28.57 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15831  hypothetical protein  27.73 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  26.98 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4114  protein of unknown function DUF805  30.66 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  28.99 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  28.99 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4184  protein of unknown function DUF805  29.45 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.150084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  28.99 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  28.99 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  28.99 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  28.99 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1321  hypothetical protein  26.71 
 
 		 263 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  28.85 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0755  hypothetical protein  26.23 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  30.69 
 
 		 393 aa  44.7  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  25.19 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1691  hypothetical protein  24.31 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.554195  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0427  hypothetical protein  30.39 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.082341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  30.16 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21090  predicted membrane protein  25.71 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  31.78 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  25.64 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  28.57 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  31.78 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2367  hypothetical protein  30 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2412  hypothetical protein  30 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0868  hypothetical protein  30.99 
 
 		 163 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  29.36 
 
 		 127 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  30.95 
 
 		 155 aa  41.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1013  hypothetical protein  28.72 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1841  protein of unknown function DUF805  35 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  29.27 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0934  hypothetical protein  29.25 
 
 		 308 aa  40.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0737095  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  32.2 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  33.05 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  29.37 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  31.36 
 
 		 118 aa  40  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>