74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1521 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1521  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  201  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0995988  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03531  hypothetical protein  63.27 
 
 
106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1470  hypothetical protein  42.16 
 
 
120 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00332173  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15831  hypothetical protein  40.59 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15681  hypothetical protein  39.6 
 
 
111 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119235  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15461  hypothetical protein  35.71 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.304816  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  37.62 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  35.24 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  39.33 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  32.32 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1691  hypothetical protein  28.45 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.554195  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20900  predicted membrane protein  33.04 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.761588  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  36.17 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  36.17 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  35.16 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  36.17 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2212  hypothetical protein  38.95 
 
 
183 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00418947  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  27.93 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  35.23 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0275  hypothetical protein  28.47 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.560646  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  36.9 
 
 
109 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  34.15 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  34.15 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  34.15 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  34.15 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  34.15 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  34.15 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  35.9 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  36.17 
 
 
125 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  31.17 
 
 
122 aa  51.2  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  31.17 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  31.17 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18161  hypothetical protein  29.66 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.560169 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0951  hypothetical protein  28.21 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.496665  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2604  hypothetical protein  29.13 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462072 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  31.96 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0196  hypothetical protein  28.21 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.667333  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  31.96 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4038  hypothetical protein  38.71 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  33.7 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  31.87 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0427  hypothetical protein  31.11 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.082341  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  31.87 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  31.87 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  31.87 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  32.95 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  30.43 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  28.81 
 
 
193 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  28.41 
 
 
1123 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  33.33 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  29.07 
 
 
393 aa  45.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  29.79 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  29.79 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  29.79 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  33.33 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  33.33 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  35.62 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0934  hypothetical protein  29.41 
 
 
308 aa  44.7  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0737095  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  30.21 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  30.11 
 
 
121 aa  42.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0755  hypothetical protein  30.23 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  30.53 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  30.86 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  32.53 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0992  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2412  hypothetical protein  26.88 
 
 
206 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2367  hypothetical protein  26.88 
 
 
206 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1195  hypothetical protein  30.95 
 
 
370 aa  41.2  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  31.18 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  29.7 
 
 
168 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  27.97 
 
 
166 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>