52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1470 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1470  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  235  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00332173  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15681  hypothetical protein  89.09 
 
 		 111 aa  198  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119235  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15831  hypothetical protein  87.27 
 
 		 111 aa  193  6e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15461  hypothetical protein  74.29 
 
 		 111 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.304816  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1521  hypothetical protein  42.16 
 
 		 100 aa  83.6  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0995988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03531  hypothetical protein  35.85 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  36.79 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  32.43 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  32.43 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  26.67 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  25.83 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  30.91 
 
 		 116 aa  52.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2212  hypothetical protein  35.48 
 
 		 183 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00418947  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  36.26 
 
 		 393 aa  52.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0275  hypothetical protein  28.69 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.560646  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  31 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  34.31 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  27.87 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  28.35 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  26.79 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 		 200 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  28.24 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  32.63 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  32.63 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  31.58 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  30.3 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1691  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.554195  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  28.7 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  26.96 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  26.36 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  33.7 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  26.32 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  31.96 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20900  predicted membrane protein  24.07 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.761588  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  30.3 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  30.3 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  23.28 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0933  hypothetical protein  30.3 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00253328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  26.92 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  26.92 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  26.92 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0196  hypothetical protein  31.03 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.667333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  26.92 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  26.26 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  26.26 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  26.26 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  26.26 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  26.26 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  26.26 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1841  protein of unknown function DUF805  41.46 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  32.84 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  29.81 
 
 		 386 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>