196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5942 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0248  malate synthase A  67.81 
 
 		 540 aa  676    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0819  malate synthase  62.36 
 
 		 532 aa  642    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3212  malate synthase  63.48 
 
 		 532 aa  646    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3433  malate synthase  64.3 
 
 		 532 aa  654    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.680692  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09650  malate synthase  72.41 
 
 		 521 aa  733    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.143579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5942  malate synthase A  100 
 
 		 513 aa  1032    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3270  malate synthase A  63.21 
 
 		 535 aa  637    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00067765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2261  Malate synthase  63.62 
 
 		 528 aa  632  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0633899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1139  malate synthase A  64.91 
 
 		 528 aa  620  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.749364 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08200  malate synthase  62.55 
 
 		 543 aa  618  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0683  malate synthase A  60.98 
 
 		 534 aa  621  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2163  malate synthase A  60.11 
 
 		 528 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.96116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5004  malate synthase A  62.28 
 
 		 519 aa  600  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522377  normal  0.192489 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1433  malate synthase A  59.51 
 
 		 521 aa  597  1e-169  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0710  malate synthase  60.23 
 
 		 550 aa  592  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1228  malate synthase  61.07 
 
 		 541 aa  589  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112102  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2526  malate synthase A  58.48 
 
 		 524 aa  590  1e-167  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000262788  normal  0.131578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28350  malate synthase A  61.42 
 
 		 534 aa  585  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0888845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5340  malate synthase A  59.66 
 
 		 537 aa  586  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.641734 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4798  malate synthase A  59.17 
 
 		 536 aa  587  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0582  malate synthase  59.85 
 
 		 554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0998  malate synthase A  58.13 
 
 		 562 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0074  malate synthase A  58.33 
 
 		 555 aa  567  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2227  malate synthase  61.14 
 
 		 526 aa  566  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2530  malate synthase A  56.42 
 
 		 534 aa  565  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3782  malate synthase  56.06 
 
 		 532 aa  553  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.153357  normal  0.0512216 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02090  malate synthase A  58.83 
 
 		 587 aa  546  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2064  malate synthase  54.22 
 
 		 536 aa  538  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889002  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0922  malate synthase A  59.13 
 
 		 549 aa  535  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1590  malate synthase  53.32 
 
 		 530 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00584692  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2617  malate synthase  53.32 
 
 		 530 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627283  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2092  malate synthase  53.32 
 
 		 530 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3220  malate synthase  53.32 
 
 		 530 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2475  malate synthase  53.32 
 
 		 530 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00662062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2528  malate synthase  53.32 
 
 		 530 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1302  malate synthase  53.23 
 
 		 526 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561375  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1994  malate synthase  52.94 
 
 		 530 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00500782  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1225  malate synthase  52.65 
 
 		 530 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.205342 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5361  malate synthase  52.08 
 
 		 530 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0199244  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1647  malate synthase  53.03 
 
 		 536 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0171397  normal  0.031328 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1390  malate synthase  52.46 
 
 		 527 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153679  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2005  malate synthase A  58.37 
 
 		 521 aa  522  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0415447  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2963  malate synthase  52.95 
 
 		 1110 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1236  malate synthase  53.03 
 
 		 526 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0237852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2490  malate synthase  52.64 
 
 		 536 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0199429  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1032  malate synthase  51.84 
 
 		 529 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.160729  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2071  malate synthase  52.28 
 
 		 530 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13618  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0853  malate synthase  51.76 
 
 		 529 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1228  malate synthase  51.15 
 
 		 529 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0718898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1051  malate synthase  50.95 
 
 		 529 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1951  malate synthase  51.23 
 
 		 528 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.937634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1131  malate synthase  50.95 
 
 		 529 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00452422  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2550  malate synthase A  53.08 
 
 		 526 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6025  malate synthase  52.09 
 
 		 530 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.144445  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2084  malate synthase  51.52 
 
 		 530 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0850479  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2052  malate synthase  52.09 
 
 		 530 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1209  malate synthase  50.95 
 
 		 529 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.779127 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0159  malate synthase  51.72 
 
 		 528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4165  malate synthase  52.95 
 
 		 523 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.975172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4376  malate synthase  52.3 
 
 		 523 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1181  malate synthase  50.57 
 
 		 529 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1286  malate synthase  51.76 
 
 		 529 aa  512  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000534021  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1026  malate synthase  50.95 
 
 		 529 aa  514  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1029  malate synthase  50.57 
 
 		 529 aa  514  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5698  malate synthase A  56.35 
 
 		 525 aa  513  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2616  malate synthase  54.3 
 
 		 522 aa  511  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1954  malate synthase  51.33 
 
 		 530 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00549462  normal  0.794908 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4158  malate synthase  50.57 
 
 		 529 aa  514  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0616937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3101  malate synthase  51.42 
 
 		 532 aa  509  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3198  malate synthase A  55.36 
 
 		 1111 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1363  malate synthase  51.47 
 
 		 529 aa  501  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3097  malate synthase A  55.36 
 
 		 1111 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1016  malate synthase  50.47 
 
 		 530 aa  502  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1372  malate synthase  50.85 
 
 		 530 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2998  isocitrate lyase  55.95 
 
 		 1111 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0639  malate synthase  48.66 
 
 		 532 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.840399  normal  0.050441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6437  malate synthase A  51.3 
 
 		 543 aa  493  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0218  malate synthase  48.94 
 
 		 533 aa  494  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0481486 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02910  malate synthase, putative  50.48 
 
 		 538 aa  491  1e-137  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1624  malate synthase  48.86 
 
 		 547 aa  489  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0293599  normal  0.51514 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0364  malate synthase  48.66 
 
 		 532 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1738  malate synthase  47.07 
 
 		 540 aa  488  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0294  malate synthase  48.66 
 
 		 532 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228257  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0593  malate synthase  50.85 
 
 		 541 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251212 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4248  malate synthase  47.98 
 
 		 533 aa  485  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03886  malate synthase  47.79 
 
 		 533 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.836126  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3983  malate synthase A  47.79 
 
 		 533 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4519  malate synthase  48.37 
 
 		 534 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.492257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03846  hypothetical protein  47.79 
 
 		 533 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.900743  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12308  malate synthase  47.96 
 
 		 532 aa  483  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4429  malate synthase  48.37 
 
 		 534 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4556  malate synthase  47.79 
 
 		 533 aa  483  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4503  malate synthase  49.43 
 
 		 532 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577319 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4016  malate synthase  47.79 
 
 		 533 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.931285  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4592  malate synthase  48.37 
 
 		 534 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4516  malate synthase  48.37 
 
 		 534 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.070236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4468  malate synthase  47.79 
 
 		 533 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.554471  normal  0.0868855 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5484  malate synthase  47.6 
 
 		 533 aa  481  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4394  malate synthase  48.37 
 
 		 534 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4055  malate synthase A  48.95 
 
 		 538 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>