More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3829 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3829  Methyltransferase type 11  100 
 
 
264 aa  528  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  70.5 
 
 
853 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805076  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9102  hypothetical protein  56.32 
 
 
268 aa  287  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2851  Methyltransferase type 11  38.35 
 
 
270 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0702  methyltransferase type 11  38.11 
 
 
265 aa  168  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136876  normal  0.144201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0760  methyltransferase type 11  37.55 
 
 
265 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481453  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3689  Methyltransferase type 12  37.35 
 
 
270 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00200869  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5566  methyltransferase type 12  41.5 
 
 
267 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.509991  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4137  Methyltransferase type 11  36.47 
 
 
265 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50382  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2762  putative methyltransferase  36.33 
 
 
288 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2575  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9239  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.89 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7789  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  31.66 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  30.05 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  29.06 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1020  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.833494 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0069  demethylmenaquinone methyltransferase  29.82 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  31.4 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  34.78 
 
 
168 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.65 
 
 
256 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  29.14 
 
 
256 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.14 
 
 
256 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  36.7 
 
 
215 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.03 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  28.11 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.03 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
264 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.14 
 
 
256 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
208 aa  60.1  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.17 
 
 
256 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.17 
 
 
256 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  26.83 
 
 
268 aa  58.9  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  29.19 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.29 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2290  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
226 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0672  putative RNA methylase  25.21 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.45 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.31 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0491  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.64 
 
 
288 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  34.4 
 
 
269 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  30.56 
 
 
274 aa  56.6  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  28.28 
 
 
280 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.33 
 
 
251 aa  56.6  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.59 
 
 
256 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.4 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28603  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  33.33 
 
 
249 aa  56.6  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4117  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.97 
 
 
245 aa  56.2  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.930509  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.9 
 
 
277 aa  55.8  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  32.96 
 
 
272 aa  55.8  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.42 
 
 
260 aa  55.5  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4297  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.2 
 
 
251 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4357  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.2 
 
 
251 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1262  type 11 methyltransferase  25.99 
 
 
273 aa  55.5  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4250  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.2 
 
 
251 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.2 
 
 
251 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.962772  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  31.39 
 
 
251 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.2 
 
 
251 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0176  hypothetical protein  27.73 
 
 
279 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261727  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.4 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0887672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  33.6 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.45 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.34 
 
 
251 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3915  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.31 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3945  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.34 
 
 
251 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.34 
 
 
251 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  29.71 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3512  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.27 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000892399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  34.43 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.52 
 
 
373 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2700  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  26.72 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 
273 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0740  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.76 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0333  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.58 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744081  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0348  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.58 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.43472 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  30.18 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.2 
 
 
261 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  27.1 
 
 
374 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.73 
 
 
243 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127944  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1110  hypothetical protein  30.07 
 
 
267 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  35.65 
 
 
216 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
218 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  23.74 
 
 
265 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.21 
 
 
277 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.84 
 
 
243 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  31.06 
 
 
273 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0688  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  25.62 
 
 
362 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.32 
 
 
251 aa  52.8  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
276 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  31.1 
 
 
216 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2735  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  29.78 
 
 
243 aa  53.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0158342 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.22 
 
 
249 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0458  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.75 
 
 
243 aa  52.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.886741 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2650  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.03 
 
 
243 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.067766  normal  0.282604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>