68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3786 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3786  FR47 domain protein  100 
 
 
224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00741152  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5486  FR47 domain-containing protein  55.86 
 
 
242 aa  229  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359302  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1546  GCN5-related N-acetyltransferase  57.73 
 
 
266 aa  226  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138992  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4007  GCN5-related N-acetyltransferase  56.76 
 
 
227 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0945133  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3797  FR47 domain protein  54.75 
 
 
244 aa  214  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  52.83 
 
 
213 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4353  GCN5-related N-acetyltransferase  52.49 
 
 
241 aa  211  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.734146  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30200  predicted acyltransferase  51.79 
 
 
224 aa  201  9e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.641139  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2053  FR47 domain protein  49.32 
 
 
240 aa  178  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
231 aa  176  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4396  GCN5-related N-acetyltransferase  45.05 
 
 
261 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6749  GCN5-related N-acetyltransferase  46.05 
 
 
242 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2990  GCN5-related N-acetyltransferase  46.92 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1699  FR47 domain-containing protein  45 
 
 
238 aa  161  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1220  FR47-like  45 
 
 
238 aa  161  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1672  GCN5-related N-acetyltransferase  44.55 
 
 
238 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1632  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
247 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1609  FR47 domain-containing protein  43.18 
 
 
247 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666532  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6287  GCN5-related N-acetyltransferase  42.27 
 
 
239 aa  154  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4874  GCN5-related N-acetyltransferase  44.34 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.508212  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3737  GCN5-related N-acetyltransferase  43.36 
 
 
228 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  40.58 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537027  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2433  GCN5-related N-acetyltransferase  36.74 
 
 
228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000357302  normal  0.518227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5553  GCN5-related N-acetyltransferase  37.78 
 
 
232 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1951  GCN5-related N-acetyltransferase  39.04 
 
 
227 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1737  GCN5-related N-acetyltransferase  38.79 
 
 
227 aa  125  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00558644  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0679  putative acetyltransferase  41.63 
 
 
237 aa  119  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0547  GCN5-related N-acetyltransferase  38.12 
 
 
228 aa  115  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1619  GCN5-related N-acetyltransferase  36.96 
 
 
260 aa  58.2  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4150  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
264 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  31.3 
 
 
251 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00415524  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3838  GCN5-related N-acetyltransferase  31.75 
 
 
269 aa  52  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1990  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  33.9 
 
 
160 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6861  hypothetical protein  46.3 
 
 
188 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574097  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
264 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115706  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1948  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
285 aa  46.2  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.13 
 
 
151 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0411  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
158 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0206726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0451  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  42.86 
 
 
295 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.237261  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2291  GCN5-related N-acetyltransferase  34.95 
 
 
168 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101571  normal  0.149434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0893  hypothetical protein  44.64 
 
 
337 aa  45.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7237  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.354809  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2331  GCN5-related N-acetyltransferase  29.6 
 
 
166 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194568  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0008  GCN5-related N-acetyltransferase  41.07 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.247741  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2020  GCN5-related N-acetyltransferase  40.54 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.369915 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1810  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000508978  normal  0.534907 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1777  acetyltransferase  30.86 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2563  GCN5-related N-acetyltransferase  37.88 
 
 
158 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0594  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  34.67 
 
 
297 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  26 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2895  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
281 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.446946  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2851  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
281 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4440  hypothetical protein  42.35 
 
 
256 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00246211  decreased coverage  0.000186457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2882  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
281 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0899618  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1078  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 
243 aa  42.7  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1816  GCN5-related N-acetyltransferase  27.15 
 
 
304 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3204  acetyltransferase  22.11 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1931  acetyltransferase  22.96 
 
 
261 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07340  predicted acyltransferase  32.61 
 
 
161 aa  42.4  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.633713  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0034  GCN5-related N-acetyltransferase  24.14 
 
 
239 aa  42  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1981  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
239 aa  42  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13681  predicted protein  36.07 
 
 
323 aa  42  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1753  hypothetical protein  30.26 
 
 
154 aa  41.6  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2480  GCN5-related N-acetyltransferase  38.81 
 
 
159 aa  41.6  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.144702  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0170  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
284 aa  42  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.636018  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52756  N-acetyltransferase  37.5 
 
 
189 aa  41.6  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.978055  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1848  GCN5-related N-acetyltransferase  26.96 
 
 
265 aa  41.6  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2194  acetyltransferase, gnat family  22.34 
 
 
261 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.716045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>