59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5553 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5553  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
232 aa  476  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4396  GCN5-related N-acetyltransferase  38.12 
 
 
261 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5486  FR47 domain-containing protein  39.38 
 
 
242 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359302  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  38.12 
 
 
231 aa  141  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537027  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1632  GCN5-related N-acetyltransferase  38.05 
 
 
247 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1672  GCN5-related N-acetyltransferase  37.67 
 
 
238 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4007  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
227 aa  136  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0945133  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1609  FR47 domain-containing protein  37.17 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3797  FR47 domain protein  36.94 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1699  FR47 domain-containing protein  37.67 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1951  GCN5-related N-acetyltransferase  34.96 
 
 
227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1220  FR47-like  37.67 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3737  GCN5-related N-acetyltransferase  38.14 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3786  FR47 domain protein  37.78 
 
 
224 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00741152  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  43.83 
 
 
213 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6287  GCN5-related N-acetyltransferase  37.26 
 
 
239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  35.04 
 
 
231 aa  128  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6749  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1546  GCN5-related N-acetyltransferase  35.65 
 
 
266 aa  125  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138992  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30200  predicted acyltransferase  33.93 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.641139  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1737  GCN5-related N-acetyltransferase  38.67 
 
 
227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00558644  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2433  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
228 aa  118  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000357302  normal  0.518227 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0679  putative acetyltransferase  37.84 
 
 
237 aa  116  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2990  GCN5-related N-acetyltransferase  33.8 
 
 
229 aa  115  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4353  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 
241 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.734146  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4874  GCN5-related N-acetyltransferase  36.32 
 
 
238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.508212  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0547  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 
228 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2053  FR47 domain protein  34.07 
 
 
240 aa  105  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2932  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0153421 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2827  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
182 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  0.971472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2705  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.172717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0828  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  40.74 
 
 
147 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141904  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1990  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.69 
 
 
160 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0616  GCN5-related N-acetyltransferase  37.33 
 
 
183 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.120941  normal  0.314865 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0611  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  40.74 
 
 
147 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1810  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 
251 aa  45.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000508978  normal  0.534907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1150  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.35 
 
 
158 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.372343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1167  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.35 
 
 
158 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.508689 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  33.07 
 
 
152 aa  45.4  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2886  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.79 
 
 
159 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3011  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1948  GCN5-related N-acetyltransferase  32.1 
 
 
285 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02664  hypothetical protein  28.46 
 
 
234 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3157  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.77 
 
 
145 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000750548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1586  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.754363  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2943  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.36 
 
 
149 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000136246  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1619  GCN5-related N-acetyltransferase  26.02 
 
 
260 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0003  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
320 aa  42.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1177  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.6 
 
 
158 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0246629 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17430  acetyltransferase  34.57 
 
 
317 aa  42.7  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2701  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 
304 aa  42.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4930  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
153 aa  42.4  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1078  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 
243 aa  42.4  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
262 aa  42  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1896  acetyltransferase  30 
 
 
295 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108924  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0612  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.23 
 
 
148 aa  42  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2020  GCN5-related N-acetyltransferase  30.37 
 
 
157 aa  42  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.369915 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1342  acetyltransferase  40 
 
 
264 aa  41.6  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0732306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1760  acetyltransferase, GNAT family  25.2 
 
 
286 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>