50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2433 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2433  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
228 aa  478  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000357302  normal  0.518227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1951  GCN5-related N-acetyltransferase  35.93 
 
 
227 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4007  GCN5-related N-acetyltransferase  36.7 
 
 
227 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0945133  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3786  FR47 domain protein  36.74 
 
 
224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00741152  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4396  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 
261 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3797  FR47 domain protein  36.65 
 
 
244 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  33.49 
 
 
231 aa  122  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537027  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5486  FR47 domain-containing protein  35.45 
 
 
242 aa  121  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359302  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1609  FR47 domain-containing protein  36.32 
 
 
247 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666532  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1672  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30200  predicted acyltransferase  35.65 
 
 
224 aa  118  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.641139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5553  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
232 aa  118  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1546  GCN5-related N-acetyltransferase  36.11 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138992  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1220  FR47-like  35.05 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1699  FR47 domain-containing protein  35.05 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1632  GCN5-related N-acetyltransferase  35.85 
 
 
247 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4353  GCN5-related N-acetyltransferase  34.56 
 
 
241 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.734146  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3737  GCN5-related N-acetyltransferase  34.86 
 
 
228 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2053  FR47 domain protein  33.49 
 
 
240 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0679  putative acetyltransferase  32.72 
 
 
237 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6749  GCN5-related N-acetyltransferase  35.43 
 
 
242 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0547  GCN5-related N-acetyltransferase  31.98 
 
 
228 aa  105  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1737  GCN5-related N-acetyltransferase  37.86 
 
 
227 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00558644  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4874  GCN5-related N-acetyltransferase  33.18 
 
 
238 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.508212  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
213 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2990  GCN5-related N-acetyltransferase  31.02 
 
 
229 aa  98.6  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6287  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
239 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 
251 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00415524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1619  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4150  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
264 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1078  GCN5-related N-acetyltransferase  27.48 
 
 
243 aa  49.3  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1931  acetyltransferase  23.68 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1854  GCN5-related N-acetyltransferase  39.19 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.794168  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1945  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
261 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3204  acetyltransferase  29.79 
 
 
261 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2194  acetyltransferase, gnat family  28.72 
 
 
261 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.716045  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2180  acetyltransferase, GNAT family protein  29.79 
 
 
237 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2110  acetyltransferase  28.72 
 
 
261 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1848  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2314  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
189 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462132  normal  0.0268854 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1586  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
261 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.754363  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2666  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
182 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0208114  normal  0.245921 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.95 
 
 
152 aa  43.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0008  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 
262 aa  42.4  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.247741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7336  acetyltransferase-like protein  29.07 
 
 
273 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2920  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
182 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0469  GCN5-related N-acetyltransferase  28.05 
 
 
272 aa  42  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000185465  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1948  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
285 aa  42  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>