63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4007 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4007  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
227 aa  439  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0945133  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5486  FR47 domain-containing protein  59.91 
 
 
242 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359302  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3786  FR47 domain protein  56.76 
 
 
224 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00741152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4353  GCN5-related N-acetyltransferase  56.31 
 
 
241 aa  216  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.734146  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1546  GCN5-related N-acetyltransferase  55.75 
 
 
266 aa  209  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138992  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  53.11 
 
 
213 aa  206  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30200  predicted acyltransferase  53.39 
 
 
224 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.641139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3797  FR47 domain protein  49.78 
 
 
244 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  48.2 
 
 
231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2053  FR47 domain protein  51.12 
 
 
240 aa  177  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1609  FR47 domain-containing protein  45.74 
 
 
247 aa  174  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666532  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1632  GCN5-related N-acetyltransferase  47.03 
 
 
247 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6749  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 
242 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4396  GCN5-related N-acetyltransferase  45.29 
 
 
261 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1672  GCN5-related N-acetyltransferase  43.44 
 
 
238 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1699  FR47 domain-containing protein  44.14 
 
 
238 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1220  FR47-like  44.14 
 
 
238 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2990  GCN5-related N-acetyltransferase  47.53 
 
 
229 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1951  GCN5-related N-acetyltransferase  41.78 
 
 
227 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  45.54 
 
 
231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537027  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6287  GCN5-related N-acetyltransferase  42.04 
 
 
239 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4874  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 
238 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.508212  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3737  GCN5-related N-acetyltransferase  44.34 
 
 
228 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2433  GCN5-related N-acetyltransferase  36.7 
 
 
228 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000357302  normal  0.518227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5553  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
232 aa  136  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1737  GCN5-related N-acetyltransferase  44.91 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00558644  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0547  GCN5-related N-acetyltransferase  41.7 
 
 
228 aa  124  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0679  putative acetyltransferase  39.55 
 
 
237 aa  118  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3838  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 
269 aa  62  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113052 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1078  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
243 aa  56.2  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6861  hypothetical protein  48.15 
 
 
188 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574097  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  36.79 
 
 
264 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115706  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1810  GCN5-related N-acetyltransferase  42.68 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000508978  normal  0.534907 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2291  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 
168 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101571  normal  0.149434 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1575  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  39.02 
 
 
311 aa  48.9  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0338041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  32.23 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00415524  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0014  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  49.18 
 
 
147 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268172  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1619  GCN5-related N-acetyltransferase  35.79 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0594  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  36.89 
 
 
297 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.43 
 
 
151 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06950  predicted acyltransferase  40.48 
 
 
310 aa  45.8  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246585  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13454  ribosomal protein alanine acetyltransferase rimI  38.1 
 
 
158 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00191083  hitchhiker  0.000645998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2120  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
278 aa  45.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2418  GCN5-related N-acetyltransferase  41.25 
 
 
246 aa  45.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1755  hypothetical protein  27.93 
 
 
172 aa  44.3  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6547  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.26 
 
 
152 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0486  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
270 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4142  GCN5-related N-acetyltransferase  40.19 
 
 
320 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.164365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4150  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
588 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2364  GCN5-related N-acetyltransferase  37.37 
 
 
394 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.212134 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0348  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.52 
 
 
144 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3590  GCN5-related protein N-acetyltransferase  42.37 
 
 
322 aa  42.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2725  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  31.36 
 
 
323 aa  42.4  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00719898 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4649  GCN5-related N-acetyltransferase  37.33 
 
 
169 aa  42  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3716  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.23 
 
 
151 aa  42  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0086441  hitchhiker  0.00862742 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3879  GCN5-related N-acetyltransferase  47.27 
 
 
153 aa  42  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.444089  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1948  GCN5-related N-acetyltransferase  25.9 
 
 
285 aa  42  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2541  GCN5-related N-acetyltransferase  38.16 
 
 
273 aa  42  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2480  GCN5-related N-acetyltransferase  37.97 
 
 
159 aa  41.6  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.144702  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4211  GCN5-related N-acetyltransferase  36.51 
 
 
313 aa  42  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189304  normal  0.011866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2331  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
166 aa  41.6  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194568  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>