59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2053 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2053  FR47 domain protein  100 
 
 
240 aa  468  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2990  GCN5-related N-acetyltransferase  58.18 
 
 
229 aa  224  9e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5486  FR47 domain-containing protein  54.19 
 
 
242 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359302  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1546  GCN5-related N-acetyltransferase  52.59 
 
 
266 aa  202  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138992  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3797  FR47 domain protein  51.6 
 
 
244 aa  195  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  54.4 
 
 
213 aa  191  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3786  FR47 domain protein  49.32 
 
 
224 aa  178  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00741152  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4007  GCN5-related N-acetyltransferase  51.12 
 
 
227 aa  177  9e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0945133  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4353  GCN5-related N-acetyltransferase  53.46 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.734146  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30200  predicted acyltransferase  47.69 
 
 
224 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.641139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  44.39 
 
 
231 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6287  GCN5-related N-acetyltransferase  42.01 
 
 
239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3737  GCN5-related N-acetyltransferase  41.96 
 
 
228 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1609  FR47 domain-containing protein  43.18 
 
 
247 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666532  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1672  GCN5-related N-acetyltransferase  43.17 
 
 
238 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6749  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
242 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4396  GCN5-related N-acetyltransferase  40.81 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1632  GCN5-related N-acetyltransferase  43.18 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1699  FR47 domain-containing protein  41.85 
 
 
238 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1220  FR47-like  41.85 
 
 
238 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  41.9 
 
 
231 aa  126  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537027  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0679  putative acetyltransferase  41.1 
 
 
237 aa  125  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4874  GCN5-related N-acetyltransferase  41.1 
 
 
238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.508212  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1951  GCN5-related N-acetyltransferase  34.06 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1737  GCN5-related N-acetyltransferase  52.07 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00558644  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2433  GCN5-related N-acetyltransferase  33.49 
 
 
228 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000357302  normal  0.518227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5553  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 
232 aa  105  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0547  GCN5-related N-acetyltransferase  42.57 
 
 
228 aa  94  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3838  GCN5-related N-acetyltransferase  34.13 
 
 
269 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  32.8 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115706  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
262 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4150  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
264 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
263 aa  48.9  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1948  GCN5-related N-acetyltransferase  25.29 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1078  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3646  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 
168 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13454  ribosomal protein alanine acetyltransferase rimI  39.29 
 
 
158 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00191083  hitchhiker  0.000645998 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0626  acetyltransferase  31.86 
 
 
185 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.551251  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0594  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  35.11 
 
 
297 aa  45.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2440  GCN5-related N-acetyltransferase  33.68 
 
 
154 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.102944 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1810  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000508978  normal  0.534907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3736  GCN5-related N-acetyltransferase  42.17 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.944087  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4371  GCN5-related N-acetyltransferase  39.51 
 
 
253 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6861  hypothetical protein  63.64 
 
 
188 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574097  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2434  GCN5-related N-acetyltransferase  33.68 
 
 
154 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  31.5 
 
 
139 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.631639  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24460  acetyltransferase  41.1 
 
 
187 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2120  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 
278 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2393  GCN5-related N-acetyltransferase  33.68 
 
 
154 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0898256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1622  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
139 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1685  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
277 aa  42.7  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0171402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
150 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406329  normal  0.262902 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1848  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 
265 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1775  GCN5-related N-acetyltransferase  42.42 
 
 
197 aa  42.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17430  acetyltransferase  35.48 
 
 
317 aa  42.4  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07340  predicted acyltransferase  30.43 
 
 
161 aa  42  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.633713  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
174 aa  41.6  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.631657  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06950  predicted acyltransferase  36.36 
 
 
310 aa  41.6  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246585  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4479  GNAT family acetyltransferase  32.58 
 
 
175 aa  42  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.89727  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>