37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1699 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1220  FR47-like  100 
 
 
238 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1699  FR47 domain-containing protein  100 
 
 
238 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1672  GCN5-related N-acetyltransferase  95.38 
 
 
238 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4874  GCN5-related N-acetyltransferase  81.51 
 
 
238 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.508212  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1609  FR47 domain-containing protein  68.67 
 
 
247 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666532  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1632  GCN5-related N-acetyltransferase  67.38 
 
 
247 aa  299  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6749  GCN5-related N-acetyltransferase  48.37 
 
 
242 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6287  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
239 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5486  FR47 domain-containing protein  43.64 
 
 
242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359302  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4396  GCN5-related N-acetyltransferase  43.18 
 
 
261 aa  162  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3786  FR47 domain protein  45 
 
 
224 aa  161  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00741152  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3737  GCN5-related N-acetyltransferase  45.09 
 
 
228 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4007  GCN5-related N-acetyltransferase  44.14 
 
 
227 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0945133  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1951  GCN5-related N-acetyltransferase  40.45 
 
 
227 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1546  GCN5-related N-acetyltransferase  43.95 
 
 
266 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138992  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0547  GCN5-related N-acetyltransferase  43.69 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  41.15 
 
 
231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537027  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  41.98 
 
 
213 aa  145  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30200  predicted acyltransferase  38.79 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.641139  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4353  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 
241 aa  138  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.734146  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5553  GCN5-related N-acetyltransferase  37.67 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1737  GCN5-related N-acetyltransferase  42.29 
 
 
227 aa  132  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00558644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3797  FR47 domain protein  40.91 
 
 
244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2053  FR47 domain protein  41.85 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0679  putative acetyltransferase  38.5 
 
 
237 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  40.18 
 
 
231 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2433  GCN5-related N-acetyltransferase  35.05 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000357302  normal  0.518227 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2990  GCN5-related N-acetyltransferase  38.26 
 
 
229 aa  105  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00415524  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.75 
 
 
151 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4150  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
264 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13454  ribosomal protein alanine acetyltransferase rimI  31.79 
 
 
158 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00191083  hitchhiker  0.000645998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5311  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
311 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0532  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.95 
 
 
147 aa  45.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237603  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76181  N-terminal acetyltransferase  31.78 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6547  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.91 
 
 
152 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4037  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
167 aa  42  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>