47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1632 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1632  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
247 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1609  FR47 domain-containing protein  92.71 
 
 
247 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666532  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1672  GCN5-related N-acetyltransferase  67.38 
 
 
238 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1699  FR47 domain-containing protein  67.38 
 
 
238 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1220  FR47-like  67.38 
 
 
238 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4874  GCN5-related N-acetyltransferase  65.24 
 
 
238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.508212  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4396  GCN5-related N-acetyltransferase  49.11 
 
 
261 aa  178  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5486  FR47 domain-containing protein  47.03 
 
 
242 aa  175  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359302  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6749  GCN5-related N-acetyltransferase  45.54 
 
 
242 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4007  GCN5-related N-acetyltransferase  47.03 
 
 
227 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0945133  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3786  FR47 domain protein  45.45 
 
 
224 aa  158  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00741152  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6287  GCN5-related N-acetyltransferase  42.92 
 
 
239 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3737  GCN5-related N-acetyltransferase  46.26 
 
 
228 aa  155  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1951  GCN5-related N-acetyltransferase  39.01 
 
 
227 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3797  FR47 domain protein  46.33 
 
 
244 aa  148  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  44.34 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  41.15 
 
 
231 aa  145  8.000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537027  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1546  GCN5-related N-acetyltransferase  45.18 
 
 
266 aa  142  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138992  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0679  putative acetyltransferase  41.01 
 
 
237 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5553  GCN5-related N-acetyltransferase  38.05 
 
 
232 aa  138  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0547  GCN5-related N-acetyltransferase  42.67 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1737  GCN5-related N-acetyltransferase  43.11 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00558644  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2053  FR47 domain protein  43.18 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4353  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 
241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.734146  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  40.53 
 
 
231 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30200  predicted acyltransferase  38.43 
 
 
224 aa  122  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.641139  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2990  GCN5-related N-acetyltransferase  38.05 
 
 
229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2433  GCN5-related N-acetyltransferase  35.85 
 
 
228 aa  115  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000357302  normal  0.518227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4150  GCN5-related N-acetyltransferase  25.86 
 
 
264 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3838  GCN5-related N-acetyltransferase  36.15 
 
 
269 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00415524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3935  GCN5-related N-acetyltransferase  33.59 
 
 
158 aa  50.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1619  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
260 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1099  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.36 
 
 
150 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2331  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
166 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194568  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 
264 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115706  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1662  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, putative  31.33 
 
 
145 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0218  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.12 
 
 
150 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3736  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.944087  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4037  GCN5-related N-acetyltransferase  28.17 
 
 
167 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1392  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.93 
 
 
148 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000164567  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2277  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.06 
 
 
167 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.27 
 
 
159 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.5 
 
 
151 aa  42.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0687  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
157 aa  42.4  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.54 
 
 
150 aa  42  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588882  normal  0.610129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0893  hypothetical protein  35.23 
 
 
337 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>