28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0540 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 251 aa  493  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00415524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4440  hypothetical protein  42.55 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00246211  decreased coverage  0.000186457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1782  GCN5-related N-acetyltransferase  40.95 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.282158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4874  GCN5-related N-acetyltransferase  36.61 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.508212  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1220  FR47-like  32.43 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1699  FR47 domain-containing protein  32.43 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2433  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000357302  normal  0.518227 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4396  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1672  GCN5-related N-acetyltransferase  32.55 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3786  FR47 domain protein  31.3 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00741152  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1609  FR47 domain-containing protein  29.94 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666532  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12430  acetyltransferase (GNAT) family protein  33.04 
 
 		 270 aa  52  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0999637  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6287  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1632  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1951  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3829  GCN5-related N-acetyltransferase  35.77 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0524773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2374  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 		 264 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3797  FR47 domain protein  32.52 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4007  GCN5-related N-acetyltransferase  32.23 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0945133  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3737  GCN5-related N-acetyltransferase  29.69 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3838  GCN5-related N-acetyltransferase  27.71 
 
 		 269 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113052 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30200  predicted acyltransferase  31.71 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.641139  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4353  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.734146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0620  GCN5-related N-acetyltransferase  38.18 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.0919465 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0836  acetyltransferase  30.16 
 
 		 182 aa  42.7  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.312661  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0547  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 		 228 aa  42.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1737  GCN5-related N-acetyltransferase  31.93 
 
 		 227 aa  42  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00558644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1586  GCN5-related N-acetyltransferase  21.08 
 
 		 261 aa  42  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.754363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>