51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1609 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1609  FR47 domain-containing protein  100 
 
 		 247 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666532  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1632  GCN5-related N-acetyltransferase  92.71 
 
 		 247 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1672  GCN5-related N-acetyltransferase  68.67 
 
 		 238 aa  314  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1220  FR47-like  68.67 
 
 		 238 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1699  FR47 domain-containing protein  68.67 
 
 		 238 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4874  GCN5-related N-acetyltransferase  64.81 
 
 		 238 aa  278  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.508212  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5486  FR47 domain-containing protein  47.49 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359302  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4396  GCN5-related N-acetyltransferase  46.64 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6749  GCN5-related N-acetyltransferase  44.8 
 
 		 242 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4007  GCN5-related N-acetyltransferase  45.74 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0945133  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6287  GCN5-related N-acetyltransferase  44.21 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3737  GCN5-related N-acetyltransferase  44.93 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3786  FR47 domain protein  43.18 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00741152  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1951  GCN5-related N-acetyltransferase  37.67 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  43.87 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3797  FR47 domain protein  43.58 
 
 		 244 aa  144  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  39.61 
 
 		 231 aa  144  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0679  putative acetyltransferase  40.55 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1546  GCN5-related N-acetyltransferase  40.81 
 
 		 266 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0547  GCN5-related N-acetyltransferase  42.67 
 
 		 228 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5553  GCN5-related N-acetyltransferase  37.17 
 
 		 232 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1737  GCN5-related N-acetyltransferase  42.67 
 
 		 227 aa  136  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00558644  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2053  FR47 domain protein  43.18 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4353  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.734146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30200  predicted acyltransferase  37.96 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.641139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  38.77 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2433  GCN5-related N-acetyltransferase  36.32 
 
 		 228 aa  121  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000357302  normal  0.518227 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2990  GCN5-related N-acetyltransferase  37.17 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4150  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3838  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00415524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1619  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  32.99 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1099  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.36 
 
 		 150 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2331  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 		 166 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13454  ribosomal protein alanine acetyltransferase rimI  34.11 
 
 		 158 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00191083  hitchhiker  0.000645998 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2277  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.91 
 
 		 167 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1392  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.93 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000164567  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3935  GCN5-related N-acetyltransferase  33.59 
 
 		 158 aa  47  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0218  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.12 
 
 		 150 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3736  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.944087  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.5 
 
 		 151 aa  46.6  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.67 
 
 		 159 aa  45.8  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.27 
 
 		 150 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588882  normal  0.610129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5311  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4037  GCN5-related N-acetyltransferase  27.14 
 
 		 167 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1586  GCN5-related N-acetyltransferase  24.63 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.754363  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0348  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.22 
 
 		 144 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0687  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.48 
 
 		 157 aa  42.7  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0291  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.96 
 
 		 147 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3230  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.44 
 
 		 162 aa  42.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>