75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0547 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0547  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
228 aa  447  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4396  GCN5-related N-acetyltransferase  52.68 
 
 
261 aa  199  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1737  GCN5-related N-acetyltransferase  52.84 
 
 
227 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00558644  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3737  GCN5-related N-acetyltransferase  50.44 
 
 
228 aa  185  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1951  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  47.27 
 
 
231 aa  162  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537027  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1672  GCN5-related N-acetyltransferase  43.24 
 
 
238 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1699  FR47 domain-containing protein  43.69 
 
 
238 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1220  FR47-like  43.69 
 
 
238 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1609  FR47 domain-containing protein  42.67 
 
 
247 aa  151  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666532  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6749  GCN5-related N-acetyltransferase  41.26 
 
 
242 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4874  GCN5-related N-acetyltransferase  42.6 
 
 
238 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.508212  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1632  GCN5-related N-acetyltransferase  42.67 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6287  GCN5-related N-acetyltransferase  42.66 
 
 
239 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3797  FR47 domain protein  42.4 
 
 
244 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4007  GCN5-related N-acetyltransferase  41.7 
 
 
227 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0945133  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1546  GCN5-related N-acetyltransferase  42.79 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138992  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3786  FR47 domain protein  40.18 
 
 
224 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00741152  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5486  FR47 domain-containing protein  41.89 
 
 
242 aa  118  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359302  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2433  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000357302  normal  0.518227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5553  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 
232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  37.67 
 
 
213 aa  108  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2990  GCN5-related N-acetyltransferase  36.68 
 
 
229 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30200  predicted acyltransferase  36.41 
 
 
224 aa  102  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.641139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0679  putative acetyltransferase  38.81 
 
 
237 aa  101  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2053  FR47 domain protein  36.62 
 
 
240 aa  98.6  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  35.35 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4353  GCN5-related N-acetyltransferase  36.24 
 
 
241 aa  89  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.734146  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.08 
 
 
148 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  33.08 
 
 
148 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.08 
 
 
148 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.08 
 
 
148 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.08 
 
 
148 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.08 
 
 
148 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.08 
 
 
148 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.08 
 
 
148 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4916  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  31.54 
 
 
148 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000006262  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 
264 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115706  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
263 aa  52  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1810  GCN5-related N-acetyltransferase  40.7 
 
 
251 aa  52.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000508978  normal  0.534907 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  37.8 
 
 
282 aa  51.6  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3838  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 
269 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113052 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1078  GCN5-related N-acetyltransferase  30.94 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12430  acetyltransferase (GNAT) family protein  29.69 
 
 
270 aa  48.9  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0999637  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
160 aa  48.5  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0034  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0611  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.23 
 
 
147 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1948  GCN5-related N-acetyltransferase  30.11 
 
 
285 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2418  GCN5-related N-acetyltransferase  41.25 
 
 
246 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3716  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.89 
 
 
151 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0086441  hitchhiker  0.00862742 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0828  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  29.46 
 
 
147 aa  45.4  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141904  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2908  hypothetical protein  28.95 
 
 
158 aa  45.4  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0532  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  31.01 
 
 
147 aa  45.4  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237603  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1782  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 
263 aa  45.1  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.282158  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2597  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  47.37 
 
 
165 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
156 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1715  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.85 
 
 
168 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1821  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
158 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.477403  normal  0.159791 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4972  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  43.28 
 
 
98 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4879  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  43.28 
 
 
98 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00181448  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4811  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  43.28 
 
 
98 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345894  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4966  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  43.28 
 
 
98 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013936  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4914  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  43.28 
 
 
98 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0583375  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0486  GCN5-related N-acetyltransferase  42.31 
 
 
270 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13454  ribosomal protein alanine acetyltransferase rimI  31.65 
 
 
158 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00191083  hitchhiker  0.000645998 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1167  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32 
 
 
158 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.508689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1150  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32 
 
 
158 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.372343  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1177  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32 
 
 
158 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0246629 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 
262 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1153  acetyltransferase domain-containing protein  23.86 
 
 
264 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 
251 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00415524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4440  hypothetical protein  36.36 
 
 
256 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00246211  decreased coverage  0.000186457 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1402  GNAT family acetyltransferase  33.73 
 
 
278 aa  42  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346646  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0616  GCN5-related N-acetyltransferase  37.29 
 
 
183 aa  41.6  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.120941  normal  0.314865 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
256 aa  41.6  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>