40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1078 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1078  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
243 aa  493  1e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
263 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1948  GCN5-related N-acetyltransferase  27.82 
 
 
285 aa  96.7  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3797  FR47 domain protein  33.59 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5486  FR47 domain-containing protein  32.54 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359302  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1737  GCN5-related N-acetyltransferase  29.1 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00558644  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0034  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  34.58 
 
 
213 aa  59.7  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4007  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
227 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0945133  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
231 aa  55.8  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6287  GCN5-related N-acetyltransferase  32.52 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4396  GCN5-related N-acetyltransferase  29.23 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537027  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0547  GCN5-related N-acetyltransferase  30.94 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2990  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.91 
 
 
148 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1546  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138992  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  32.71 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2433  GCN5-related N-acetyltransferase  27.48 
 
 
228 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000357302  normal  0.518227 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3737  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
228 aa  49.3  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1685  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
277 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0171402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2053  FR47 domain protein  29.09 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6749  GCN5-related N-acetyltransferase  28.05 
 
 
242 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4353  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 
241 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.734146  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1043  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 
294 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0110092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2186  GCN5-related N-acetyltransferase  29.24 
 
 
278 aa  45.4  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322958  hitchhiker  0.00131223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2252  acetyltransferase  34.43 
 
 
189 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000131288  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0181  metalloendopeptidase, glycoprotease family  42.59 
 
 
832 aa  44.3  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1586  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
261 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.754363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1347  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
177 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2559  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
247 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3786  FR47 domain protein  29.01 
 
 
224 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00741152  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5553  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 
232 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1714  putative acetyltransferase  32.93 
 
 
242 aa  42.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1931  acetyltransferase  30.95 
 
 
261 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2180  acetyltransferase, GNAT family protein  30.95 
 
 
237 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3204  acetyltransferase  30.95 
 
 
261 aa  42  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
160 aa  42  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1521  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
280 aa  42  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.76241  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>