56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1546 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1546  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
266 aa  523  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138992  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3797  FR47 domain protein  64.73 
 
 
244 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  57.75 
 
 
213 aa  239  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5486  FR47 domain-containing protein  54.58 
 
 
242 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359302  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3786  FR47 domain protein  57.73 
 
 
224 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00741152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4353  GCN5-related N-acetyltransferase  55.13 
 
 
241 aa  221  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.734146  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4007  GCN5-related N-acetyltransferase  55.75 
 
 
227 aa  209  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0945133  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2053  FR47 domain protein  52.59 
 
 
240 aa  202  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30200  predicted acyltransferase  52.02 
 
 
224 aa  194  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.641139  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2990  GCN5-related N-acetyltransferase  51.38 
 
 
229 aa  181  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  45.74 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4396  GCN5-related N-acetyltransferase  48.67 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1672  GCN5-related N-acetyltransferase  43.95 
 
 
238 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1699  FR47 domain-containing protein  43.95 
 
 
238 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1220  FR47-like  43.95 
 
 
238 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6749  GCN5-related N-acetyltransferase  41.47 
 
 
242 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6287  GCN5-related N-acetyltransferase  40.85 
 
 
239 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3737  GCN5-related N-acetyltransferase  44.09 
 
 
228 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1632  GCN5-related N-acetyltransferase  45.18 
 
 
247 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1609  FR47 domain-containing protein  40.81 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666532  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1951  GCN5-related N-acetyltransferase  40.79 
 
 
227 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  43.24 
 
 
231 aa  135  8e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537027  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4874  GCN5-related N-acetyltransferase  47.85 
 
 
238 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.508212  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1737  GCN5-related N-acetyltransferase  53.33 
 
 
227 aa  133  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00558644  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0547  GCN5-related N-acetyltransferase  41.89 
 
 
228 aa  125  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5553  GCN5-related N-acetyltransferase  35.65 
 
 
232 aa  125  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2433  GCN5-related N-acetyltransferase  36.11 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000357302  normal  0.518227 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0679  putative acetyltransferase  38.64 
 
 
237 aa  109  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4150  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
264 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6861  hypothetical protein  81.82 
 
 
188 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574097  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1078  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  35.04 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
264 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115706  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  35.66 
 
 
160 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3838  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
269 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0451  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  38.71 
 
 
295 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.237261  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1619  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 
260 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1990  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.48 
 
 
160 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  36.59 
 
 
184 aa  45.4  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04993  acetyltransferase, GNAT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09940)  35.62 
 
 
213 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0636839 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1701  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
189 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0034  GCN5-related N-acetyltransferase  28.09 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2020  GCN5-related N-acetyltransferase  33.01 
 
 
157 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.369915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13454  ribosomal protein alanine acetyltransferase rimI  38.2 
 
 
158 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00191083  hitchhiker  0.000645998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2252  acetyltransferase  36.07 
 
 
189 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000131288  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1884  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 
156 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0722359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4440  hypothetical protein  32.48 
 
 
256 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00246211  decreased coverage  0.000186457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1945  GCN5-related N-acetyltransferase  25.66 
 
 
261 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2563  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 
158 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0348  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.26 
 
 
144 aa  42.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1575  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  30.6 
 
 
311 aa  42.7  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0338041 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.95 
 
 
151 aa  42.7  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1948  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
285 aa  42.7  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4371  GCN5-related N-acetyltransferase  38.75 
 
 
253 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2899  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.25 
 
 
168 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256111  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 
812 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>