298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3671 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3671  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
380 aa  753    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16025  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  25.85 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.71 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.67 
 
 
516 aa  70.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  30.48 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001794  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase II  30.77 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.578647  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.16 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  35 
 
 
352 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1796  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.65 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0153252 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00680  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  29.27 
 
 
352 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.33 
 
 
360 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.48 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  35.9 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.94 
 
 
346 aa  63.2  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.01 
 
 
344 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.28 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1612  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.1 
 
 
346 aa  62  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
344 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.96 
 
 
337 aa  60.1  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.67 
 
 
354 aa  60.1  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.17 
 
 
339 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
333 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  29.97 
 
 
381 aa  59.7  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  34.38 
 
 
343 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0172  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  32.5 
 
 
350 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.063279  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.38 
 
 
343 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.58 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1297  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.82 
 
 
357 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3193  glycosyl transferase family protein  32.28 
 
 
345 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.558162  normal  0.892869 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03477  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.5 
 
 
348 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000025219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0085  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.5 
 
 
348 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000038978  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  39.09 
 
 
347 aa  58.9  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0089  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.5 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000834595  normal  0.156713 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  25.27 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3831  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.5 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000276456  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3957  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.5 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000313085  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03428  hypothetical protein  31.5 
 
 
348 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000123646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4993  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.5 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211589  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4123  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.5 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0437858  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4047  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.5 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000910947  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3929  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.5 
 
 
348 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3991  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.5 
 
 
348 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  30.73 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0465  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.89 
 
 
344 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3910  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.5 
 
 
348 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0899  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.8 
 
 
354 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4036  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.5 
 
 
348 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4097  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.5 
 
 
348 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  22.42 
 
 
344 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  26.98 
 
 
356 aa  57.4  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  26.98 
 
 
356 aa  57.4  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.48 
 
 
346 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1991  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
351 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.010394  normal  0.201882 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0665  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.29 
 
 
345 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1967  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  28.88 
 
 
418 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  32.41 
 
 
335 aa  57  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0576  heptosyltransferase  28.88 
 
 
418 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1601  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.26 
 
 
358 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0749  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 
331 aa  57  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.481302  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0669  heptosyltransferase  28.88 
 
 
418 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.822838  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  32.64 
 
 
343 aa  56.6  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.7 
 
 
341 aa  57  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4370  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.11 
 
 
355 aa  57  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.29 
 
 
345 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  23.96 
 
 
354 aa  56.6  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4089  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.85 
 
 
349 aa  56.6  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.85 
 
 
354 aa  56.6  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
390 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  38.05 
 
 
415 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0579  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.1 
 
 
347 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0417722 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.9 
 
 
345 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  24.47 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  39.45 
 
 
402 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.9 
 
 
345 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
347 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1247  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.69 
 
 
339 aa  56.2  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.313368  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
409 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.48 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0545  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.77 
 
 
340 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0086605  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.48 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0508  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.26 
 
 
317 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.104736  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0116  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.15 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
369 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  25.17 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4826  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  30.37 
 
 
348 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290967  hitchhiker  0.000199841 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0291  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.48 
 
 
346 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3947  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  28.8 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  31.36 
 
 
361 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0586  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.48 
 
 
346 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.3 
 
 
349 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.48 
 
 
346 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1613  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.04 
 
 
358 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.938574  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2419  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.48 
 
 
346 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0032  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.6 
 
 
376 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.67 
 
 
350 aa  53.9  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0309  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 
345 aa  53.9  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3077  glycosyl transferase family 9  24.31 
 
 
355 aa  53.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212218 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5747  heptosyltransferase II  28.93 
 
 
345 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66250  heptosyltransferase II  31.4 
 
 
345 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
386 aa  53.9  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>