More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2280 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_13260  DNA topoisomerase IV subunit B  49.93 
 
 		 701 aa  647    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0630779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1763  DNA topoisomerase IV subunit B  52.09 
 
 		 709 aa  676    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1922  DNA topoisomerase IV subunit B  51.64 
 
 		 708 aa  640    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.921776  normal  0.0348119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2394  DNA topoisomerase  53.71 
 
 		 690 aa  688    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367142  normal  0.572955 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2134  DNA topoisomerase IV subunit B  53.62 
 
 		 702 aa  713    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1613  DNA topoisomerase IV subunit B  50.22 
 
 		 702 aa  662    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000263124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1674  DNA gyrase subunit B  75.99 
 
 		 730 aa  1074    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.759972 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15990  DNA topoisomerase IV subunit B  50.14 
 
 		 710 aa  654    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.440467  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7084  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.54 
 
 		 690 aa  662    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1680  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  75.7 
 
 		 702 aa  1071    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.313615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1988  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.06 
 
 		 715 aa  662    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1534  DNA topoisomerase IV subunit B  51.61 
 
 		 693 aa  637    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.300498  normal  0.0102248 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1425  DNA topoisomerase IV subunit B  51.28 
 
 		 723 aa  672    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15910  DNA topoisomerase IV subunit B  50.78 
 
 		 709 aa  669    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.39843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2280  DNA gyrase subunit B domain protein  100 
 
 		 680 aa  1377    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.557074  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1611  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.98 
 
 		 696 aa  665    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00143665  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08220  DNA topoisomerase IV subunit B  80.79 
 
 		 701 aa  1154    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3307  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.61 
 
 		 701 aa  689    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1619  DNA topoisomerase IV subunit B  50.36 
 
 		 702 aa  671    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0681707  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2958  DNA topoisomerase IV subunit B  50.8 
 
 		 710 aa  654    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414962  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14380  DNA topoisomerase IV subunit B  49.5 
 
 		 705 aa  627  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2055  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  49.79 
 
 		 713 aa  620  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1427  DNA topoisomerase IV subunit B  51.83 
 
 		 703 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0298  DNA topoisomerase plasmid partition protein B  43.37 
 
 		 758 aa  579  1e-164  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  40.93 
 
 		 640 aa  514  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  42.3 
 
 		 686 aa  514  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  43.09 
 
 		 633 aa  513  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  41.77 
 
 		 714 aa  512  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  42.28 
 
 		 636 aa  500  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  42.61 
 
 		 657 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  39.43 
 
 		 633 aa  500  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  42.14 
 
 		 654 aa  501  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  42.32 
 
 		 628 aa  499  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  41.77 
 
 		 675 aa  498  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  41.63 
 
 		 675 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0005  DNA gyrase, B subunit  41.23 
 
 		 685 aa  498  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  41.59 
 
 		 636 aa  496  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  41.63 
 
 		 675 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  41.63 
 
 		 675 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  41.34 
 
 		 675 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  40.93 
 
 		 644 aa  495  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  41.59 
 
 		 636 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  41.55 
 
 		 650 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  42.92 
 
 		 695 aa  491  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000061906 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  41.53 
 
 		 634 aa  489  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  41.7 
 
 		 649 aa  491  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0009  DNA gyrase, B subunit  40.92 
 
 		 688 aa  491  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  42.71 
 
 		 653 aa  486  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  42.66 
 
 		 635 aa  488  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  40.99 
 
 		 637 aa  486  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0007  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  42.71 
 
 		 647 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  40.27 
 
 		 645 aa  486  1e-136  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0007  DNA gyrase, B subunit  41.89 
 
 		 670 aa  487  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  40 
 
 		 647 aa  487  1e-136  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  42.49 
 
 		 696 aa  486  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00060  DNA gyrase subunit B  42.73 
 
 		 683 aa  482  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  40.74 
 
 		 648 aa  484  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  41.88 
 
 		 636 aa  483  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  38.82 
 
 		 655 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  42 
 
 		 649 aa  481  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  40.12 
 
 		 655 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00050  DNA gyrase subunit B  42.61 
 
 		 720 aa  481  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  41.17 
 
 		 640 aa  479  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  40.85 
 
 		 655 aa  481  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0006  DNA gyrase subunit B  43.13 
 
 		 647 aa  480  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.195447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  39.32 
 
 		 652 aa  480  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  41.96 
 
 		 645 aa  480  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  42.37 
 
 		 661 aa  477  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  38.53 
 
 		 655 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  42.75 
 
 		 661 aa  477  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  39.44 
 
 		 655 aa  478  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  39.09 
 
 		 658 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  40.48 
 
 		 632 aa  476  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0006  DNA gyrase B subunit  41.56 
 
 		 656 aa  477  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  38.75 
 
 		 637 aa  478  1e-133  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  38.97 
 
 		 655 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  41.27 
 
 		 643 aa  475  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  39.7 
 
 		 654 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  39.85 
 
 		 654 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  39.85 
 
 		 654 aa  474  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  39.85 
 
 		 654 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  39.34 
 
 		 634 aa  474  1e-132  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0335  DNA gyrase, B subunit  40.83 
 
 		 645 aa  473  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  40.24 
 
 		 648 aa  475  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  39.85 
 
 		 654 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  39 
 
 		 655 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  38.8 
 
 		 655 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  39.7 
 
 		 654 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  41.39 
 
 		 641 aa  474  1e-132  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  40.75 
 
 		 644 aa  475  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  39.85 
 
 		 654 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  39.76 
 
 		 654 aa  475  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  41.92 
 
 		 635 aa  473  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  39.7 
 
 		 644 aa  473  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  40.42 
 
 		 642 aa  474  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  40.38 
 
 		 642 aa  473  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  39.82 
 
 		 641 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  42.43 
 
 		 719 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  38.65 
 
 		 655 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  39.7 
 
 		 650 aa  470  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>