135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1834 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  100 
 
 		 59 aa  125  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3503  protein of unknown function DUF397  58.93 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  56.6 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  52.83 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  55.56 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  51.92 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  53.7 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  51.92 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  47.37 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  46.43 
 
 		 80 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  53.7 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  42.37 
 
 		 63 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  49.12 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1229  protein of unknown function DUF397  53.57 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0775452  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  49.12 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6374  protein of unknown function DUF397  50.88 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  46.55 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0673  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  46.55 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  45.61 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  41.38 
 
 		 67 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  51.92 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  46.55 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  48.15 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  52.94 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  50.91 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  49.06 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  45.28 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0108  protein of unknown function DUF397  50.98 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  42.65 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  49.06 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  51.85 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  48.21 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  40.91 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1162  protein of unknown function DUF397  47.27 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490498  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 		 63 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  40.68 
 
 		 82 aa  50.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  51.92 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  48.21 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  43.86 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  46.43 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  44.83 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  48.15 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1480  protein of unknown function DUF397  50.91 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  45.45 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  43.1 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  42.59 
 
 		 62 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  47.17 
 
 		 64 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  45.61 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  54.55 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  42.42 
 
 		 76 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3777  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  46.3 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  43.55 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  42.11 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4454  protein of unknown function DUF397  43.1 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  46.55 
 
 		 62 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  43.4 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  45.45 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  45.76 
 
 		 68 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 		 60 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 		 60 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  42.11 
 
 		 65 aa  47.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  45.28 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4783  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4568  hypothetical protein  45.61 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0924  hypothetical protein  39.66 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  42.11 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  44.44 
 
 		 60 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3780  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4579  protein of unknown function DUF397  44.23 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  44.44 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4087  protein of unknown function DUF397  41.82 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  44.44 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  40.91 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  49.02 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1627  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 		 59 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  46.15 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  42.11 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4378  hypothetical protein  44.44 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  46.3 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3779  protein of unknown function DUF397  38.6 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  39.66 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4784  protein of unknown function DUF397  42.11 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 		 55 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4272  protein of unknown function DUF397  38.89 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  41.18 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>