More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1747 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1747  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 352 aa  721    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.94845  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8495  glycosyl transferase family 2  48.85 
 
 		 351 aa  299  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.796901 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4802  glycosyl transferase family protein  43.85 
 
 		 373 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1932  glycosyl transferase family protein  48.98 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.876392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1383  glycosyl transferase family protein  37.81 
 
 		 339 aa  205  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3903  glycosyl transferase family 2  40.29 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  39.19 
 
 		 338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3382  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1054  hypothetical protein  36.16 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0430  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.03 
 
 		 337 aa  165  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.03 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00522517  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 		 376 aa  116  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 349 aa  105  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 		 318 aa  99.4  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 318 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  29.13 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2369  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 		 335 aa  96.3  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 623 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 		 337 aa  93.2  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 321 aa  93.2  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 329 aa  93.2  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 277 aa  92.8  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 363 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  23.61 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2187  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 343 aa  90.5  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.804947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 347 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 235 aa  89.7  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 		 311 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.49 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.78 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  30.13 
 
 		 355 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.35 
 
 		 341 aa  87.4  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 718 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 727 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 		 1177 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 		 1177 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.46 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0331  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 1035 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0330  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.2 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  28.88 
 
 		 255 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 285 aa  82.4  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 703 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 1250 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  25.57 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  34.9 
 
 		 1118 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 1252 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  24.73 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  22.95 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 1252 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  37.5 
 
 		 700 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  36.92 
 
 		 760 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  25.25 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00201  glycosyl transferase  29.24 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.91 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  27.83 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  22.95 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  23.95 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  38.02 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2024  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394379 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.51 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  34.19 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 		 1124 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1163  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  32.38 
 
 		 275 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0532064  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 		 303 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>