More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8495 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8495  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
351 aa  707    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.796901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1747  glycosyl transferase family 2  48.85 
 
 
352 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.94845  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4802  glycosyl transferase family protein  48.34 
 
 
373 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858117  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1383  glycosyl transferase family protein  39.54 
 
 
339 aa  209  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1932  glycosyl transferase family protein  39.44 
 
 
373 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.876392  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1054  hypothetical protein  39.21 
 
 
304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3903  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 
369 aa  176  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 
338 aa  168  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.5 
 
 
316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00522517  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0430  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.86 
 
 
337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3382  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165683  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 
330 aa  96.7  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 
235 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
349 aa  92.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 
334 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.67 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 
376 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
1177 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
1177 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  29.23 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
358 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2369  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.6 
 
 
312 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
727 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3881  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
335 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 
501 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
597 aa  77.4  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
623 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
363 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 
277 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1163  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.62 
 
 
275 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0532064  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.43 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2187  glycosyl transferase family 2  23.36 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.804947  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 
777 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4301  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2600  glycosyl transferase family 2  23.64 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.16 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06300  glycosyl transferase  36.36 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0269612 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  27.47 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
760 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1282  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  35.64 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
544 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  23.9 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
1032 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  30.29 
 
 
700 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3723  hypothetical protein  28.48 
 
 
333 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 
305 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
1035 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0331  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  29.78 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0330  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  23.4 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 
703 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1278  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  25.16 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0908017  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  21.19 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  26.28 
 
 
708 aa  67  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1156  beta-1,3-galactosyltransferase  23.6 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000973066  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0582  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  34.65 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  30.45 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  26.67 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2458  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00372639  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4436  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  35.4 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2024  glycosyl transferase family 2  24.54 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394379 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 
338 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.75 
 
 
466 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
294 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>