44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1230 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  100 
 
 		 73 aa  148  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  47.3 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  48.61 
 
 		 74 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  41.18 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  48.61 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  38.03 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  38.03 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  45.07 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  39.73 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  42.25 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  41.43 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  41.43 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  40.28 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  40.28 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  38.81 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  43.66 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  45.31 
 
 		 76 aa  52.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0980  YcfA family protein  36.92 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000157599  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  40 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2669  YcfA family protein  54.35 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.16159 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  37.5 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  37.5 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  44.62 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0555  YcfA family protein  41.43 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1951  YcfA family protein  37.68 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.508484 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  41.27 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1936  YcfA family protein  37.68 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.797457 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0484  YcfA-like  40 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0494568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1322  YcfA-like  34.78 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  43.86 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0621  YcfA-like protein  41.54 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3102  YcfA-like  38.03 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  0.0893777 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  39.68 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  43.28 
 
 		 78 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  43.55 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0298  YcfA-like  40.26 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0701  YcfA family protein  40.85 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00509047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3128  YcfA family protein  43.1 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.195816 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1246  YcfA family protein  36 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1010  hypothetical protein  29.17 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000868639  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1512  YcfA family protein  33.33 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1838  hypothetical protein  33.93 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1661  hypothetical protein  40 
 
 		 62 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  31.51 
 
 		 74 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>