More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0775 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0775  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  356  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1162  hypothetical protein  58.38 
 
 		 182 aa  191  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  58.19 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4082  hypothetical protein  57.47 
 
 		 188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0271621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4008  hypothetical protein  57.47 
 
 		 188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4238  hypothetical protein  57.47 
 
 		 188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727087 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11229  hypothetical protein  53.93 
 
 		 187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  56.33 
 
 		 201 aa  167  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4132  hypothetical protein  53.71 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3750  hypothetical protein  52 
 
 		 181 aa  164  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226065  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2184  hypothetical protein  57.63 
 
 		 187 aa  164  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000227609  normal  0.582537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3024  hypothetical protein  47.4 
 
 		 191 aa  159  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.695841 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  49.72 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  43.1 
 
 		 197 aa  151  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  45.93 
 
 		 200 aa  150  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3313  hypothetical protein  53.45 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  44.19 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3118  hypothetical protein  46.74 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0494504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  44.83 
 
 		 197 aa  148  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  44.83 
 
 		 197 aa  148  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1174  hypothetical protein  51.7 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0253429  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  44.51 
 
 		 203 aa  143  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0909  hypothetical protein  43.53 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  43.21 
 
 		 193 aa  141  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  45.81 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  43.35 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0876  hypothetical protein  47.98 
 
 		 198 aa  138  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1841  hypothetical protein  49.71 
 
 		 198 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.086843  normal  0.221662 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  45.86 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  43.02 
 
 		 190 aa  136  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  39.29 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1144  conserved hypothetical protein 730  45.35 
 
 		 216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263245  decreased coverage  0.00451054 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  41.57 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8427  hypothetical protein  47.67 
 
 		 195 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  38.95 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  43.37 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3769  hypothetical protein  43.02 
 
 		 440 aa  131  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.0729973 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  44.83 
 
 		 191 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  40.57 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  44.19 
 
 		 195 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  45.45 
 
 		 196 aa  131  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  43.6 
 
 		 195 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  36.16 
 
 		 186 aa  130  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1143  hypothetical protein  39.53 
 
 		 181 aa  130  7.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  43.18 
 
 		 195 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  41.81 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  45.81 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  45.16 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06310  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  47.67 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  38.01 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  39.64 
 
 		 179 aa  129  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  43.83 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  40.91 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  44.32 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  44.32 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  38.42 
 
 		 186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1739  hypothetical protein  44.77 
 
 		 197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  43.68 
 
 		 193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  39.53 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  42.61 
 
 		 197 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  43.93 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  43.87 
 
 		 199 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  44.71 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4700  hypothetical protein  39.29 
 
 		 204 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  41.18 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  37.43 
 
 		 230 aa  125  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0139  hypothetical protein  45.39 
 
 		 217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  38.29 
 
 		 194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1620  Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.05 
 
 		 183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.215928  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  40 
 
 		 194 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  38.07 
 
 		 193 aa  124  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  39.11 
 
 		 201 aa  124  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  40.11 
 
 		 195 aa  124  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  42.94 
 
 		 193 aa  124  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  42.94 
 
 		 193 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  42.94 
 
 		 193 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2080  hypothetical protein  42.94 
 
 		 193 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.723086  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  42.94 
 
 		 193 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  38.15 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  38.6 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  37.71 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1454  hypothetical protein  38.76 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350903  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  39.66 
 
 		 200 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79930  predicted protein  34.18 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.529779  normal  0.351185 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  39.26 
 
 		 194 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  42.33 
 
 		 194 aa  121  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  42.33 
 
 		 194 aa  121  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1797  hypothetical protein  42.37 
 
 		 193 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1876  hypothetical protein  41.67 
 
 		 208 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  41.94 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1920  hypothetical protein  36.26 
 
 		 225 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  40.79 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  39.43 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  41.14 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  40.96 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  38.33 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  45.1 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  40.79 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  40.12 
 
 		 195 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  33.92 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>