More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1144 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1144  conserved hypothetical protein 730  100 
 
 		 216 aa  425  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263245  decreased coverage  0.00451054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8427  hypothetical protein  54.74 
 
 		 195 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3024  hypothetical protein  51.96 
 
 		 191 aa  178  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.695841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  49.71 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1841  hypothetical protein  53.04 
 
 		 198 aa  167  9e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.086843  normal  0.221662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1174  hypothetical protein  53.45 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0253429  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0876  hypothetical protein  55.43 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0775  hypothetical protein  45.35 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4238  hypothetical protein  48.24 
 
 		 188 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4008  hypothetical protein  48.24 
 
 		 188 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4082  hypothetical protein  48.24 
 
 		 188 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0271621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  48.24 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  43.82 
 
 		 195 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  42.94 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  43.43 
 
 		 195 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11229  hypothetical protein  44.25 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2184  hypothetical protein  51.25 
 
 		 187 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000227609  normal  0.582537 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  42.53 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  40.22 
 
 		 194 aa  138  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  40.91 
 
 		 190 aa  137  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  40.86 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  44.38 
 
 		 193 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  41.01 
 
 		 195 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  46.05 
 
 		 197 aa  134  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  46.05 
 
 		 197 aa  134  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2182  decarboxylase family protein  45.98 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  44.74 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  38.59 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3118  hypothetical protein  48.57 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0494504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  41.24 
 
 		 200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  40.45 
 
 		 193 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3313  hypothetical protein  47.78 
 
 		 187 aa  131  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  36.98 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  40.45 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  43.18 
 
 		 195 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  43.18 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  41.01 
 
 		 194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  42.58 
 
 		 179 aa  129  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06310  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  44.38 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  41.01 
 
 		 194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  39.89 
 
 		 194 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  43.68 
 
 		 196 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  40.45 
 
 		 194 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  39.77 
 
 		 193 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  40.34 
 
 		 193 aa  128  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  39.77 
 
 		 195 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  40 
 
 		 186 aa  128  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  39.25 
 
 		 193 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  39.25 
 
 		 193 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  38.04 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1162  hypothetical protein  45.45 
 
 		 182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  38.92 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0720  hypothetical protein  38.85 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00620883  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  38.04 
 
 		 194 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  39.33 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0704  hypothetical protein  38.85 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  39.89 
 
 		 193 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  38.71 
 
 		 193 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  38.59 
 
 		 194 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  36.79 
 
 		 195 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  36.79 
 
 		 195 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  36.79 
 
 		 195 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  36.79 
 
 		 195 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  36.79 
 
 		 195 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3199  hypothetical protein  42.31 
 
 		 196 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  34.54 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  36.79 
 
 		 195 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  39.11 
 
 		 184 aa  124  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  38.04 
 
 		 186 aa  124  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  41.04 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1739  hypothetical protein  42.41 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  40.68 
 
 		 180 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  38.55 
 
 		 184 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3627  hypothetical protein  37.02 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4132  hypothetical protein  42.37 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  40.96 
 
 		 180 aa  122  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  45.81 
 
 		 180 aa  122  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  35.75 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  34.83 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3750  hypothetical protein  41.81 
 
 		 181 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226065  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  44.16 
 
 		 195 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  42.04 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4700  hypothetical protein  36.21 
 
 		 204 aa  121  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3769  hypothetical protein  42.29 
 
 		 440 aa  121  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.0729973 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  42.68 
 
 		 205 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  41.4 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  40.8 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  42.35 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  40.91 
 
 		 193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5209  decarboxylase family protein  35.91 
 
 		 192 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  35.8 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  37.43 
 
 		 184 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  40.12 
 
 		 207 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0335  decarboxylase family protein  35.71 
 
 		 188 aa  118  7.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5194  decarboxylase family protein  34.81 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0328593  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  39.53 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0048  decarboxylase family protein  35.36 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  hitchhiker  2.41999e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5199  decarboxylase family protein  35.36 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00410284  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  39.77 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4781  lysine decarboxylase family protein  35.36 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>