More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4132 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4132  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  353  5.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3750  hypothetical protein  90.61 
 
 
181 aa  299  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226065  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3024  hypothetical protein  50.29 
 
 
191 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.695841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4238  hypothetical protein  54.39 
 
 
188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0727087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4008  hypothetical protein  54.39 
 
 
188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4082  hypothetical protein  54.39 
 
 
188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0271621  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0775  hypothetical protein  54.39 
 
 
180 aa  181  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  51.43 
 
 
201 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1174  hypothetical protein  53.71 
 
 
197 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0253429  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3313  hypothetical protein  56.82 
 
 
187 aa  175  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1162  hypothetical protein  52.87 
 
 
182 aa  173  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0876  hypothetical protein  54.6 
 
 
198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8427  hypothetical protein  55.43 
 
 
195 aa  170  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  51.46 
 
 
185 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11229  hypothetical protein  52.35 
 
 
187 aa  165  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  45.14 
 
 
186 aa  154  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1841  hypothetical protein  50 
 
 
198 aa  155  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.086843  normal  0.221662 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  42.53 
 
 
197 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  46.37 
 
 
195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2184  hypothetical protein  54.25 
 
 
187 aa  151  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000227609  normal  0.582537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  46.37 
 
 
195 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  46.37 
 
 
195 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3118  hypothetical protein  50 
 
 
207 aa  147  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0494504  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  47.74 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  45.45 
 
 
195 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  47.74 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  46.02 
 
 
195 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  41.99 
 
 
201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  46.02 
 
 
195 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  44.32 
 
 
195 aa  144  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  42.7 
 
 
185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4700  hypothetical protein  41.14 
 
 
204 aa  144  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  46.82 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  46.82 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  40.91 
 
 
193 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  47.27 
 
 
193 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  46.24 
 
 
193 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  41.52 
 
 
177 aa  141  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  42.13 
 
 
195 aa  140  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  39.77 
 
 
190 aa  139  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  46.63 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  40.88 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  46.5 
 
 
211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  45.09 
 
 
194 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  45.09 
 
 
194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  43.93 
 
 
193 aa  138  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  40 
 
 
193 aa  137  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  44.85 
 
 
179 aa  137  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  46.79 
 
 
196 aa  137  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  41.38 
 
 
178 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  43.96 
 
 
184 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  43.93 
 
 
194 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  43.96 
 
 
184 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0357  hypothetical protein  45.66 
 
 
198 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  43.02 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3199  hypothetical protein  49.71 
 
 
196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  41.57 
 
 
184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  41.57 
 
 
193 aa  135  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  42.48 
 
 
191 aa  135  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  41.82 
 
 
194 aa  134  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  41.71 
 
 
200 aa  134  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  42.77 
 
 
194 aa  134  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  39.08 
 
 
207 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  42.26 
 
 
194 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  44.51 
 
 
192 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  43.35 
 
 
193 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  41.48 
 
 
194 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  41.86 
 
 
199 aa  133  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  42.2 
 
 
194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  39.11 
 
 
197 aa  132  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  40.91 
 
 
194 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  42.86 
 
 
200 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  40 
 
 
207 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  42.61 
 
 
180 aa  131  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  38.18 
 
 
186 aa  131  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  40.45 
 
 
195 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  44.16 
 
 
201 aa  130  9e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  40.45 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  42.48 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  42.2 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06310  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  46.93 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  43.31 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  41.62 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  41.38 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3769  hypothetical protein  44.25 
 
 
440 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.0729973 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  41.62 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  41.62 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  41.62 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  40.34 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  40.45 
 
 
199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  37.93 
 
 
206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  50.72 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  42.04 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  41.62 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  39.89 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  41.62 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1454  hypothetical protein  41.24 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350903  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  40.68 
 
 
194 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  41.04 
 
 
195 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2080  hypothetical protein  42.61 
 
 
193 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.723086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>